Teniendo en cuenta que el 2003 la Reserva de Biosfera Seaflower fue denominada como Área Importante para la Conservación de las Aves o Important Bird Area) (AICA o IBA) por BirdLife y el Instituto Von Humboldt (Moreno et.al, 2003) por lo tanto el monitoreo de este grupo aviario es clave para generar información base que nos ayude a entender las tendencias y el comportamiento de la fauna asociada a ecosistemas costeros a través del tiempo y poder implementar acciones de manejo y conservación a largo plazo.
El plan de acción y conservación para el Aves Marinas y Playeras del archipiélago (García, 2004) presenta un programa de monitoreo a largo plazo para estos grupos aviarios y se desarrollan las siguientes ocho (8) estrategias de manejo tendientes a la recuperación y conservación de la avifauna marino costera en el Seaflower MPA.
- Manejo y protección de hábitats de hábitats de anidación
- Manejo y protección de hábitats de parada, paso del invierno, alimentación y recuperación de fuerzas: Lagunas marino costeras, Manglares, Humedales y playas.
- Análisis de Pesca Incidental de Aves Marinas con Longline en el MPA
- Controlar Contaminantes en el medio marino Aceites e Hidrocarburos y Otros contaminantes o sustancias peligrosas.
- Manejo y protección de los diferentes estadios de vida
- Fomentar y Apoyar la Cooperación Internacional
- Fortalecer la educación ambiental
- Incremento en el intercambio de información
